微阵列(原位)

微阵列(原位)

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微阵列的概述

微阵列由在矩形网格产生生物溶液的斑点。微阵列技术包括用于功能基因组学,药物基因组学,SNP基因分型,蛋白组学和细胞信号传导的应用程序。微阵列可以通过分配预先合成的生物材料(的cDNA,PCR产物,肽/蛋白质,等等),或者通过实际直接通过产生在基底上生物材料来制造bob盲盒在哪里买原位合成。

微阵列可以包含在几平方厘米的面积几千样本。这些阵列通过从单独的管预合成生物材料的沉积的装置的制造可能是不切实际的,由于单独的合成,纯化和后勤需求。原位合成的优点是只需要非常小体积的不同合成试剂,而不考虑微阵列内不同最终产物的数量。bob盲盒在哪里买综合衍生的表面结合生物材料减少了物流和处理问题的限制。合成的材料可以用交联试剂、染料、生物素和核苷酸类似物修饰。喷墨是理想的分配流体涉及到合成,因为它是一种非接触技术,它不会交叉污染流体。bob正常玩会被黑吗

MicroFab一直致力于微阵列的生产原位合成DNA和肽。这两个项目是由美国国立卫生研究院资助SBIR(一期为DNA和一,二期为肽)赞助。

DNA微阵列

DNA微阵列分析已收到显著的关注与承诺,以进一步推进生物技术和我们的单元的基础分子途径的理解的技术。高密度DNA阵列的发展已经出现,作为全球基因组测序工作的结果。基因组测序项目已在基因组学下一代的研究提供了重要的工具。用于高密度DNA阵列的吸引力和需求已经通过谁在单一实验中期望有效地扫描数千细胞和组织系统基因表达活性的研究人员驱动。DNA微阵列技术包括这样的应用如突变检测,功能基因组学,药物基因组学,SNP基因分型,基因表达研究,蛋白质组和细胞信号传导。

MICROFAB技术公司是美国国立卫生研究院第一阶段SBIR为收件人原位合成寡核苷酸微阵列对基因表达研究的。我们的喷墨技术被用来合成试剂的小体积递送到基材上。原基因实验室还利用我们的喷墨装置,以合成在其上被销售自Flex芯片技术达80聚体在长度,玻璃寡核苷酸阵列。这些FlexChips是容易定制的应用,包括基因作图,SNP基因分型,基因表达监测,和其它药物基因组学的用途。MICROFAB技术优化,并提供喷墨装置,以原基因被掺入到他们的原位DNA合成设备。该系统由计算机控制的X和Y台组成,用于将衬底置于喷墨喷嘴下。分别为四个核苷酸单体提供了一个独立的喷墨装置,第五个装置用于递送用于合成偶联的激活试剂。合成过程中包含在无水腔内的玻璃基片和喷墨装置。

左-在原位喷墨合成DNA的过程步骤概述。右下角- MicroFab技术喷墨装置安装在原始基因实验室喷墨DNA合成器。右上角的储层与四磷灰石溶液配合使用喷墨装置。

用于单体和活化剂的溶剂可以是乙腈和己二腈或碳酸丙烯酯的混合物。该系统的关键是使用图案基板通过不同的表面张力分离液体(见下图)。试剂的微滴沉积在载玻片上成千上万的润湿特性形成的狭窄沥青功能化结合位点上。


微图案衬底的概念,利用原生基因实验室在玻璃衬底上原位合成dna[图像由原生基因实验室提供]。点击图片放大

多肽微阵列

肽在细胞和组织中发挥着重要的功能作用,因此肽研究对生命科学和医药工业具有重要的意义。通过使用一种组合的方法,合成肽在单个单元中以非常大的数量分组,一个微阵列格式的肽库,从而允许大规模加速样品处理。一种可被自动分析的柔性肽微阵列是药物发现过程中减少筛选时间的理想工具。肽微阵列的一些应用是:

  • 定义最小的蛋白 - 蛋白相互作用结构域 - 表位作图
  • 关键残基鉴定 - 鉴定参与结合的残
  • 一般药物筛选-与药物的相互作用以确定药物先导物
  • 蛋白质构象探针-评价多个结合域的结合
  • 蛋白质-DNA,蛋白质 - 多糖,蛋白质 - 细胞,蛋白质 - 金属相互作用 - 蛋白质和其他分子之间的相互作用

肽syntehsis的示意图当使用原位合成该肽在微阵列中所需的位置产生,每次产生一个残基。这种方法的主要优势在于该过程中所涉及的液体数量有限:20种(天然)氨基酸以及用于洗涤、堵塞(封盖)和去保护的液体。合成开始于氨基酸分布在一个衍生的底物上(在每个位置可以有不同的氨基酸)。在沉积和反应完成的偶联时间之后,底物经历了封顶,其中减量物上的连接位点被阻塞,以供将来的反应使用。偶联氨基酸在所有位置都失去保护,然后肽链上的下一个氨基酸在每个位置都沉积下来。清洗步骤也在全球进行,以去除残留的试剂。

MicroFab的肽合成平台在MICROFAB我们已经建立了基于Fmoc化学合成系统。氨基酸分配子系统被呈现在图中向右移动。在图片中的照相机确定初始将在控制程序中使用的分配器的偏移,以确保所有的氨基酸需要在该微阵列的一个位置将完全重叠分配。

在MicroFab上合成的肽通过溴酚染色(在合成结束时检测游离胺)、裂解肽的HPLC和MS分析,以及在微阵列中直接在肽上附着抗体和染色来验证。下面提供了一些示例。



的肽的溴酚蓝染色

溴酚蓝染色脑啡肽对纤维素合成的支持。bob171下载



HPLC法评价脑啡肽的合成。脑啡肽的洗脱时间为9.85分钟。



通过抗体附着和蛋白质印迹脑啡肽合成评价。暗点旁边18表示在其中执行抗体附件的syntheiss位置。